Viiruslik hemorraagiline septitseemia (VHS) ja vereloomeorganite infektsioosne nekroos (IHN)
Haiguse tutvustused:
ANALÜÜSIMEETODID
|
Analüüs |
Meetod |
Metoodika |
Osakond |
|
VHS/IHN viiruse isoleerimine rakukultuuris |
Viiruse isoleerimine rakukultuuris (VI) |
5DV-TJ-72 |
Viroloogia-seroloogia |
|
VHS viiruse antigeeni tuvastamine antigeeni ELISA |
Ag ELISA |
5DV-TJ-92 |
Viroloogia-seroloogia |
|
IHN viiruse antigeeni tuvastamine antigeeni ELISA |
Ag ELISA |
5DV-TJ-92 |
Viroloogia-seroloogia |
|
IHN viiruse RNA tuvastamine |
Real-time RT-PCR |
5MA-TJ-84 |
Molekulaaranalüüs |
|
VHS viiruse RNA tuvastamine |
Real-time RT-PCR |
5MA-TJ-2 |
Molekulaaranalüüs |
Analüüsid viiruste täpsemaks iseloomustamiseks
|
Analüüs |
Meetod |
Metoodika LABRISes |
Osakond |
|
VHS ja IHN viiruste genoomi iseloomustamine |
sekveneerimine |
- |
Molekulaaranalüüs / EURL (DTU, Taani)* |
*allhange (EURL- Euroopa Liidu referentlaboratoorium kalade haiguste alal)
Analüüsimeetod viiruse tuvastamiseks (VI ja/või PCR) valitakse sõltuvalt uuringu eesmärgist. Haiguskahtluse ja/või ebaselge uurimistulemuse puhul teostatakse alati ka viiruse tuvastamise teise analüüsimeetodiga. Viiruse antigeeni tuvastamist ELISA meetodil kasutatakse vajadusel viiruse isoleerimisel rakukultuuris, et määrata kultuuris tsütopaatiat põhjustanud viirus. Sekveneerimine teostatakse vajadusel isoleeritud/tuvastatud viiruse täpsemaks geneetiliseks iseloomustamiseks (nt genotüübi määramine) ning epidemioloogia selgitamiseks.
ANALÜÜSE TEOSTAV LABORATOORIUM
Tartu laboratoorium- Kreutzwaldi 30, Tartu
PROOVIDE VÕTMINE, SÄILITAMINE JA SAATMINE
Proovide võtmine ja pakkimine
Minimaalne uurimiseks vajalik proovide arv sõltub kala kaalust:
- > 150 g - 5 kala;
- 5-150 g - 10 kala;
- < 5 g - 20 kala (maimu).
Proovideks valitakse erineva haigusstaatusega kalad:
- väliste haigustunnusteta näiliselt terved kalad;
- haiguskahtlusega kalad;
- nähtavate kliiniliste tunnustega kalad.
Kui haigestumine või haiguskahtlus on probleemiks mitmes veekogus/basseinis, võetakse proovid erinevatest veekogudest/basseinidest.
Eluskalade laborisse saatmiseks pannakse need kahekordsesse kilekotti või sobiva suurusega veekindlasse anumasse, milles on 1/3 vett ja 2/3 hapnikku (kala biomass ei tohi ületada 1/3 vee hulgast).
Jahutatult jääl või külmkehadega saatmiseks püütakse kalad ja pakitakse kilekotti või keeratakse pärgamentpaberisse ning jahutatakse piisava koguse jää või külmakehade abil.
Proovide märgistamine ja kaaskiri
Proovid märgistatakse selgelt ja üheselt mõistetavalt. Koos proovidega saadetakse laborisse korrektselt täidetud ja piisavalt infot sisaldav kaaskiri, mille leiab LABRISe kodulehelt tellimuste vormid alt.
Proovide laborisse saatmine
- Eluskala puhul peavad proovid laborisse jõudma 12 tunni jooksul pärast proovi võtmist.
- Jahutatud proovid peaksid laborisse jõudma 6 tunni jooksul pärast proovi võtmist.
- Tellija poolt tagatakse külmaahel proovide transportimise ajal. Proovi temperatuur ei tohi tõusta üle 10°C (saadetise vastuvõtmisel peab transpordikastis veel jääd alles olema või vähemalt üks külmakeha peab olema osaliselt külmunud). PROOVE MITTE KÜLMUTADA!
ANALÜÜSI TEOSTAMISE AEG
Real-time PCR: 1-3 tööpäeva
Viiruse isoleerimine rakukultuuris: kuni kaks nädalat
Sekveneerimine: kuni üks nädal (allhanke puhul pikem)
PS! Laborit teavitatakse ette proovide eeldatavast saabumisajast.
ANALÜÜSIMEETODID
ELISA: ensüüm-immuunsorptsioonmeetod
VI: viiruse isoleerimine rakukultuuris
RT- PCR: pöördtranskriptsiooni polümeraasi ahelreaktsioon Sekveneerimine: Sanger sekveneerimine
TÄIENDAV INFO JA KONTAKTID
- Üldised kalade haiguste küsimused: peaspetsialist loomahaiguste alal Triin Tedersoo, Kontakt: tel: 738 6122; mobiil: 518 5383; e-post: triin.tedersoo@vetlab.ee.
- Viroloogia-seroloogia osakond. Info telefonil 738 6111
- Molekulaaranalüüsi osakond. Info telefoni 738 6121
Koostatud: 03.06.2019
Koostanud: Triin Tedersoo
